Hallo Dan und willkommen hier!
Glaube, es ist relativ "normal", dass man bei der Art Gewinde Klebereste findet.
Schön ist es nicht, aber damit haben viele Hersteller zu kämpfen gehabt. Wenn es hält und du ggf den Rest entfernen kannst, sollte es gut genug sein. Wenn dich die Optik nicht stört, bzw man es nicht von Außen sieht, kannst du es sogar so lassen.
Ein Wermutstropfen bleibt es aber trotzdem...
den kleber kann man abknibeln
Dann würde ich genau das machen. Wenn das Gewinde sonst, wie du sagst, bombenfest und gerade ist, ist das o.k.
Trotzdem würde ich die Shisha immer an der Bowl hoch heben 
